Danilo's carrière als trainer begon bij Corinthians, waar hij de sub-20- en sub-23-ploegen leidde. Hij won met de sub-20-ploeg de Copa São Paulo de Futebol Júnior. Vervolgens ging hij naar Pouso Alegre, waar hij kampioen werd van de Mineiro do Interior. Daarna ging hij naar Uberlândia, waar hij de Série D won.
Danilo's succes als trainer is te danken aan zijn ervaring als speler, zijn tactische kennis en zijn vermogen om zijn ploeg te motiveren. Hij staat nu voor een nieuwe uitdaging: de halve finale van de Série D tegen ABC. Als hij wint, zal hij de finale spelen tegen Gama of ASA-AL. Danilo's toekomst als trainer lijkt rooskleurig, maar hij zal moeten blijven werken om zijn ploeg te helpen winnen.